Ресурсы

  • PyGenomics

    — программный пакет, реализующий чтение, запись и преобразование геномных интервалов между различными форматами файлов данных, использующихся в геномной биоинформатике. Процедуры пакета могут быть легко включены в конвейерные системы обработки данных, таких как , например, Snakemake.

    Репозиторий. Дополнительный пакет. Примеры использования

  • Репозиторий структурных вариантов

    — вычислительный ресурс, содержащий аннотированные паттерны сигналов покрытия последовательности, а также модели профилей сигналов, соответствующие пяти основным типам структурных вариаций. База данных содержит около 23 миллионов профилей сигналов покрытия, извлеченных из данных полногеномного секвенирования, предоставленных несколькими крупномасштабными геномными проектами (например, HGDP). Инструменты работы с данными позволяют проводить поиск и визуализацию имеющихся данных, а также выгружать профили сигналов для дальнейшей работы.

    SWaveform: https://swaveform.compbio.ru/